| Nyelv : |
|
| Enciklopédia közösség |Enciklopédia válaszok |Küldje el kérdését |Szókincs |Feltöltés ismeretek |
Primer |
  |
|
Primer tervezés befejeződött, és meg kell BLAST Detection. Ha nincs más génekkel komplementer, akkor a következő kísérlet. Érdemes megemlíteni, hogy a primer tervezés különböző sablonok különböző nehézségi. Néhány a sablon maga nehezebb körülmények között, például magas vagy alacsony GC-tartalom, ami a különböző mutatók találhatók nagyon alkalmas primerek; használt PCR klónozási célokra, mert a termék viszonylag fix szekvenciát, primer tervezés, mint a választás szabadságát alacsony. Ebben az esetben csak a második legjobb, megpróbál eleget tenni azoknak a feltételeknek.Ennek során Real Time, SYBR Green I módszert alkalmaznak egy pár primerek és a PCR-primerek általánosságban a primereket terveztünk a kívánt paraméterek különböző. Primer tervezési követelmények: ● átfedések elkerülése érdekében bázisok, különösen G. ● Tm = 58-60 fok. ● GC 30-80%. ● 3 'végén az utolsó öt bázisok nem lehet több, mint két G vagy C. ● forward primer és próba minél közelebb, annál jobb, de nem fedik egymást. ● PCR termék hossza: a termék a primer méret nem túl nagy, általában között lehet 80-250bp, 80 ~ 150 bp a legmegfelelőbb (mely bővíthető 300 bp). ● alapozó hőkezelési hőmérséklet magas, általában a 60 fok; Fordítson különös figyelmet a primer dimerek elkerülésére, és a jelenléte nem specifikus amplifikáció. És primer tervezés során figyelembe kell venni a primer még nem genomi DNS-szennyeződés befolyásolja az, hogy az a primer kell span exon, a legjobb alapozók egész exon splice terület, így hatékonyabban a genomi DNS-szennyeződés hatásokat. Dye módszer nem a legfontosabb, hogy megtaláljuk a megfelelő alapozót és környezetszennyezés megelőzése. A primer, akkor vegye ki a sok tizenkét primer alapozó mentálisan felkészült --- megtalálni a megfelelő alapozót nem volt könnyű. Körülbelül BLAST szerepét kell képest, és úgy találta, hogy van célja a primer fedezték fel, és nem hozták nyilvánosságra a génbanki fajok gén szekvenciákat, amelyek mellett és a cél gén, nincs más fajok és más A szekvencia, amelyben van, ugyanabban a sorrendben, mint a cél, és a szekvenciák azonos sorrendben azon kívül, hogy meghosszabbíthatja a termék más szekvencia, akkor a gyenge specificitása a primerek, és így nem lehet használni. Design Software ■ Oligo 6 Oligo 6 jelenleg a legelterjedtebb a primer tervező szoftver, amellett, hogy egyszerűen és gyorsan teljes különböző primer és próba tervezés és elemzés, hanem számos más hasonló szoftver nem rendelkezik a fejlett funkciók: ● az ismert szekvenciája a PCR-primer, keresés, és egyéb szekvenciákat a primerek tervezése; ● Az eltérő alfaja az MM preferencia tervezési degenerált primerek ● A gyűrű-típusú DNS-fragmenst PCR-primerek tervezése reverz; ● Tervezés multiplex PCR-primerek; ● szonda LCR reakció kimutatására tervezett, hogy van egy mutáció; ● elemzés és értékelés más módon kialakított alapozók indokolt; ● Keresés homológ szekvenciák és alapozók célja szerint a homológ régiók ● Továbbfejlesztett primer / próba kereső. Primereket terveztünk folyamat, akkor "Lock" minden paraméter, mint például a Tm érték tartományok és a primer 3 'végén a stabilitás; ● Az eredmények tárolására különböző formában, támogatja a több felhasználó, minden felhasználó tudja menteni a saját különleges beállításokat. ■ Primer Premier 5.0 Primer Premier 5.0 arra használják, hogy a kutatók meghatározzák a legmegfelelőbb alapozó szoftver segítségével a speciális alapozó keresés alapozó adatbázis beágyazott tervezett primerekkel alapozók szerkesztési és elemzési funkciók célja, hogy a hatékony erősítő képessége ideális alapozó is kialakítható legfeljebb 50KB a fenti amplifikációs láncindító a PCR-termékek szekvenciái. A szoftver elsősorban áll GeneTank sorrend szerkesztés, Primer alapozó tervezés, Igazítás szekvencia-összehasonlítás, enzim emésztés elemzés és motívum motívum áll több fő funkcionális blokkokat. |
| Használó Felülvizsgálati |
|
Nincs még hozzászólás |
